Mh, nicht so einfach, deshalb nur mal so ein paar Denkansätze:

Laufen die Skripte im selben Domainenkontext ab? Der IE ist da ja etwas empfindlicher, um Sicherheit darzustellen.

Was passiert, wenn du den Prozess soweit vereinfachst, dass er erstmal nicht viel macht, um ihn quasi zu "debuggen"?

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